Genetic diversity of two Brazilian populations of the Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus, Linnaeus 1758)

The Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) is one of the most endangered Neotropical cervid with populations that have been drastically reduced to small and isolated ones, mainly because of its habitat destruction. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to analyze population divergence and genetic variation within and between two populations corresponding to distinct subspecies. The RAPD markers displayed substantial genetic variation with all animals possessing unique RAPD phenotypes over 105 polymorphic bands produced by 15 primers. An analysis of molecular variance (AMOVA) and a neighbor-joining cluster analysis were performed to assess levels of differentiation between populations. No differentiation was recorded and about 96.0 percent (P < 0.00001) of the total variance was attributable to variation within populations. This result is quite distinct from data obtained by the analysis of the mtDNA control region, and is discussed on the basis of genetic differences between the different markers and the male-biased dispersal patterns generally observed in the mammal species. The data presented herein are potentially useful for future taxonomic and genetic studies in this species, for the monitoring of the genetic variation observed within these populations, and for the development of management guidelines for its conservation.

O Veado-campeiro (Ozotoceros bezoarticus) é uma das espécies de cervídeos neotropical mais ameaçadas devido à destruição de seu hábitat e conseqüente redução e isolamento de suas populações. Marcadores do tipo RAPD (Random amplified polymorphic DNA) foram utilizados na análise da divergência populacional e estimativa da variação genética dentro e entre duas populações correspondentes a diferentes subespécies. Os marcadores RAPD mostraram uma variação genética substancial, sendo que as 105 bandas polimórficas obtidas pelo uso de 15 primers produziram fenótipos únicos para todos os indivíduos analisados. Para avaliar o nível de diferenciação entre as populações, foi realizada uma análise da variância molecular (AMOVA) e uma análise de agrupamento utilizando o método de neighbor-joining. Nenhuma diferenciação foi observada, sendo aproximadamente 96,0 por cento da variação encontrada atribuída à variação dentro das populações estudadas. Este resultado difere do obtido através da análise da região controle do mtDNA, e é discutido levando-se em consideração as diferenças genéticas entre os diferentes marcadores utilizados e o padrão de dispersão geralmente observado nas espécies de mamíferos (realizada principalmente pelos machos). Os dados aqui apresentados poderão ser úteis para futuros estudos taxonômicos e genéticos desta espécie, para o monitoramento da variação genética observada em suas populações e para o desenvolvimento de estratégias de manejo para sua conservação.

Genetic diversity of two Brazilian populations of the Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus, Linnaeus 1758)

The Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) is one of the most endangered Neotropical cervid with populations that have been drastically reduced to small and isolated ones, mainly because of its habitat destruction. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to analyze population divergence and genetic variation within and between two populations corresponding to distinct subspecies. The RAPD markers displayed substantial genetic variation with all animals possessing unique RAPD phenotypes over 105 polymorphic bands produced by 15 primers. An analysis of molecular variance (AMOVA) and a neighbor-joining cluster analysis were performed to assess levels of differentiation between populations. No differentiation was recorded and about 96.0% (P 0.00001) of the total variance was attributable to variation within populations. This result is quite distinct from data obtained by the analysis of the mtDNA control region, and is discussed on the basis of genetic differences between the different markers and the male-biased dispersal patterns generally observed in the mammal species. The data presented herein are potentially useful for future taxonomic and genetic studies in this species, for the monitoring of the genetic variation observed within these populations, and for the development of management guidelines for its conservation.

O Veado-campeiro (Ozotoceros bezoarticus) é uma das espécies de cervídeos neotropical mais ameaçadas devido à destruição de seu hábitat e conseqüente redução e isolamento de suas populações. Marcadores do tipo RAPD (Random amplified polymorphic DNA) foram utilizados na análise da divergência populacional e estimativa da variação genética dentro e entre duas populações correspondentes a diferentes subespécies. Os marcadores RAPD mostraram uma variação genética substancial, sendo que as 105 bandas polimórficas obtidas pelo uso de 15 primers produziram fenótipos únicos para todos os indivíduos analisados. Para avaliar o nível de diferenciação entre as populações, foi realizada uma análise da variância molecular (AMOVA) e uma análise de agrupamento utilizando o método de neighbor-joining. Nenhuma diferenciação foi observada, sendo aproximadamente 96,0% da variação encontrada atribuída à variação dentro das populações estudadas. Este resultado difere do obtido através da análise da região controle do mtDNA, e é discutido levando-se em consideração as diferenças genéticas entre os diferentes marcadores utilizados e o padrão de dispersão geralmente observado nas espécies de mamíferos (realizada principalmente pelos machos). Os dados aqui apresentados poderão ser úteis para futuros estudos taxonômicos e genéticos desta espécie, para o monitoramento da variação genética observada em suas populações e para o desenvolvimento de estratégias de manejo para sua conservação.

Polymorphic variation of hemoglobins in buffaloes (Bubalus bubalis)

No presente trabalho foi estudado o polimorfismo bioquímico das hemoglobinas de 96 búfalos indianos de diferentes cruzamentos envolvendo as raças Murrah, Jafarabadi e Mediterrâneo, criados na Fazenda Experimental Lageado - UNESP - Botucatu, Estado de Säo Paulo. As variantes de hemoglobinas foram identificadas através de eletroforese em gel de Agar-Amido em sistema de tampäo descontínuo, pH 8,6. Animais portando uma banda rápida (A1) foram considerados AA (4,4 por cento); búfalos com duas bandas (A1 e A2) foram considerados AB (31,87 por cento) quando A2 era mais fraca e BB (31,87 por cento) quando A2 era mais forte. Uma terceira banda foi encontrada, chamada N. Fenótipos com três bandas foram encontrados com as respectivas frequências; ABN (3,3 por cento) e BBN (30,77 por cento). Análises densitométricas e a falta de animais AAN levaram à conclusäo que, de alguma forma, a síntese da cadeia Beta mutante que origina a banda N esteja relacionada provavelmente ao alelo AlfaII. Provavelmente, a alta frequência de animais com banda N seja devida ao uso intenso de poucos reprodutores

Possible association between hemoglobin types and reproductive disorders in Brazilian Mangalarga mares

Foram estudadas as hemoglobinas de 100 éguas da raça Mangalarga, em idade de reproduçäo, provenientes da Fazenda Santa Fé, situada na regiäo de Botucatu. Esses animais foram divididos em 2 grupos, de acordo com o histórico reprodutivo de cada animal, sendo um formado por éguas reprodutivamente normais e o segundo por éguas portadoras de problemas reprodutivos. Foram colhidas amostras de 15 ml de sangue com anticoagulante. As hemoglobinas foram identificadas por meio de eletroforese em gel de poliacrilamida em placa vertical, a 7 por cento em pH 8.6, segundo Davis11 (1964). Quanto ao sistema de hemoglobinas, foram encontrados os seguinte fenótipos para o grupo de éguas reprodutivamente normais: A1--- (2,0 por cento), A1A2m+m+ (21,0 por cento) e A1A2m+m- (27,0 por cento); para o grupo de éguas com problemas reprodutivos: A1--- (10,0 por cento), A1A2m+m+ (12,0 por cento) e A1A2m+m- (28,0 por cento). A diferença na frequência do fenótipo A1--- entre os grupos pode ter ocorrido devido à existência da ligaçäo do loco hemoglobina a outro que controlaria características de produçäo. Além disso, pode estar ocorrendo influência do tipo de clima existente nos trópicos

An improved electrophoretic method for the determination of serum milk protein variants in Gyr-Holstein cows

Milk serum proteins such as alpha-lactalbumin (ALA) and beta-lactoglobulin (BLG) present biochemical polymorphism which is under the control of codominant autosomal alleles. In the present report, we propose modifications of traditional electrophoretic techniques such as increasing the running gel concentration from 5 to 10% and the addition of 5 M urea to the stacking gel, which permitted the detection of two variants (A and B) at the ALA and BLG loci. About 8 microliters of milk serum (6 mg/ml protein) and 10 microliters of total fresh milk were applied. Bovine serum albumin (BSA) and immunolactoglobulins (ILG) could also be discriminated. Total fresh milk was as useful as the purified serum milk proteins for the discrimination of ALA and BLG serum milk protein polymorphism by alkaline vertical slab polyacrylamide gel electrophoresis. However, BSA and ILG ran with caseins, which prevented their characterization in this system